سیستم های اندوممبران در سلول های یوکاریوتی شامل موارد زیل می باشند:

1.  رتیکولوم اندوپلاسمیک(نرم و سخت): شبکه سخت حاوی ریبوزوم جهت پروتئین سازی می باشد / شبکه نرم فاقد ریبوزوم می باشد و درگیر بیوسنتز استروئیدها، ذخیره کلسیم، متابولیسم کربوهیدرات ها و سم زدایی می باشد.

2.. کامپلکس گلژی: اعمال این دستگاه عبارتند از:1. پردازش و آماده‌سازی محصولات تازه سنتز شده سلولی 2. گلیکوزیلاسیون پروتئین‌های ترشحی (این فرایند در شبکه آندوپلاسمی خشن آغاز می‌شود اما طویل شدن و پردازش زنجیره پلی ساکارید در گلژی انجام می‌گیرد) 3. نقش اصلی دستگاه گلژی ترشح پروتئین‌های ترشحی و آنزیمهای موجود در لیزوزوم‌ها و پراکسیزوم‌ها(در یوکاریوت ها پراکسی زوم نداریم) است.

3. اندوزوم و لیزوزوم (نه پراکسی زوم)